El expediente a España se abrió desde el pasado mes de febrero y afectaba además a Portugal, que tampoco había adoptado las medidas necesarias en Madeira y las Azores. Pero a diferencia de lo ocurrido en el caso de Canarias, las autoridades portuguesas ya han aprobado las medidas correctoras necesarias, lo que ha permitido paralizar el procedimiento. Los tres Archipiélagos forman parte de la región biogeográfica macaronésica, que contiene ecosistemas únicos. El ultimátum contra España adopta la forma de un dictamen motivado, segunda fase de un procedimiento de infracción. Si las autoridades españolas no toman las medidas exigidas en un plazo de dos meses, el Ejecutivo comunitario podría llevar el caso ante el Tribunal de Justicia de Luxemburgo (TUE). Bruselas recuerda que las autoridades españolas tendrían que haber designado en Canarias 174 espacios como zonas especiales de conservación y adoptar las medidas de protección necesarias para conservarlos como muy tarde en diciembre de 2007. Por su parte España se escusó en que supuestamente el "proceso está en marcha", pero la Comisión Europea replica que "no se ha fijado ninguna fecha definitiva para la designación ni se han tomado las medidas necesarias". Las islas macaronésicas nunca han formado parte de un territorio continental. Las plantas y los animales indígenas han llegado gracias a una diseminación a gran distancia. Estas islas preservan ecosistemas únicos característicos de estas islas volcánicas, y muchos de ellos están amenazados. Aunque las RUP "macaronésicas" sólo representa el 0,3% del territorio de la UE, acoge a cerca del 20% de sus principales tipos de hábitats y al 28% de las plantas protegidas, muchas de las cuales son endémicas de estas islas.
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